Proses penapaian mikroorganisma dalam tangki dalam dipanggil penapaian tangki dalam. Ia telah dibangunkan 50 tahun lalu oleh NCAUR, yang kemudiannya melancarkan senjata antibiotik terhadap penyakit manusia. Jackson dan rakan-rakannya menambah baik teknologi itu dengan membangunkan resipi penapaian yang lebih cekap daripada resipi sebelumnya. Kerja mereka meningkatkan pengeluaran besar-besaran spora P. fumosoroseus. Kini, mereka sedang mencari untuk menggunakannya di lapangan.
Untuk menghasilkan sejumlah besar penisilin, Amerika Syarikat dan United Kingdom mendekati syarikat kimia dan farmaseutikal terbesar di Amerika Syarikat. Pfizer berjaya menghasilkan kuantiti penisilin yang banyak melalui penapaian tangki dalam dan pada penghujung perang, penisilin tersedia secara meluas kepada askar Bersekutu. Hari ini, penapaian tangki dalam adalah kaedah yang paling banyak digunakan untuk pengeluaran farmaseutikal. Walau bagaimanapun, masih terdapat banyak batasan untuk kaedah penapaian ini. Penapaian permukaan yang tidak cekap adalah menyusahkan untuk jumlah pengeluaran yang tinggi.
Untuk membuat sejumlah besar penisilin, penyelidik Pfizer mula-mula menggunakan teknik penapaian aseptik ini untuk penghasilan asid sitrik. Apabila teknologi semakin diperhalusi, adalah mungkin untuk meningkatkan ketulenan dan potensi penisilin. Akhirnya, eksperimen Jasper Kane menunjukkan bahawa penapaian tangki dalam adalah cara yang cekap untuk menghasilkan sejumlah besar penisilin antibiotik. Pfizer memerlukan tangki penapaian yang besar untuk dapat menghasilkan antibiotik secara besar-besaran. Nasib baik, Pfizer menukar kilang ais lama di Brooklyn menjadi kilang penisilin.
Para saintis penisilin Pfizer mengalami kesukaran bekerja dengan acuan yang menyebabkan ia menghasilkan produk berkualiti tinggi. Kaedah penapaian permukaan terdedah kepada pencemaran, mengakibatkan hasil yang rendah. Apabila Kane mencadangkan penapaian tangki dalam, dia disambut dengan sambutan yang menggalakkan. Dia mencadangkan kaedah ini, tetapi syarikat itu perlu mengorbankan beberapa produk yang menguntungkan untuk menjadikannya berdaya maju secara komersial. Ini adalah cadangan berisiko untuk Pfizer, dan ia memerlukan pemberhentian produk lain.
Di makmal, penyelidik mensintesis penisilin menggunakan acuan penicillium yang secara semula jadi menghasilkan penisilin antibiotik. Acuan ini ditanam dalam tangki penapaian dalam menggunakan gula dan bahan-bahan lain. Akibatnya, antibiotik dihasilkan dan pulih pada akhir penapaian. Walau bagaimanapun, masih tidak jelas sama ada penapaian tangki dalam adalah cara yang lebih baik untuk mencipta antibiotik. Walau bagaimanapun, ia adalah teknik yang berguna untuk bioproduksi antibiotik.
Loji perintis Pfizer menggunakan kaedah Currie telah ditubuhkan pada tahun 1919. Asid sitrik yang dihasilkan menggunakan kaedah ini jauh lebih tinggi daripada jumlah yang diperoleh daripada buah sitrus. Proses ini pada mulanya tidak berjaya, tetapi akhirnya, ia menghasilkan cukup tinggi sehingga Pfizer mula menggunakannya pada produk lain. Proses ini dibangunkan dalam tangki dalam, yang membolehkan Pfizer menghasilkan asid sitrik dengan lebih cekap berbanding sebelum ini. Tidak lama kemudian teknologi penapaian mengatasi pengeluaran berasaskan buah sitrus.
